Juanjo Etxebeste inició su actividad en 1968, en un local de la Calle Fuenterrabía, de la mano del que, durante muchos años, fuera su maestro y entrenador, José Luis Úbeda Altuna.
A principios de los años 70 comienza a impartir clases de judo en los colegios de la Salle en Zarautz y Donostia, alternando su formación en el desaparecido Club Sakura de Donostia, bajo la supervisión del maestro entrenador nacional Ángel Monreal Cordobés.
En 1979 continúa con su labor pedagógica, y crea en el Barrio de Anaka el "Judo Club Anaka".
Es entrenador nacional de judo y árbitro nacional, labor que desempeñó en las olimpiadas de Barcelona.
En diciembre de 2008, y en el transcurso de la Gala Nacional del Judo Español que tuvo lugar en al auditorio del Comité Olímpico Español en Madrid, le fue concedido el diploma y carnet acreditativos del alto Grado Cinto Rojo y Blanco 7º Dan de Judo, en reconocimiento por los méritos contraídos a lo largo de su trayectoria deportiva.
Juanjo Etxebestek 1968an hasi zuen bere jarduera, Hondarribia kaleko lokal batean, urte askotan bere maisu eta entrenatzaile izan zen José Luis Úbeda Altunaren eskutik.
70eko urteen hasieran, judoko klaseak ematen hasi zen La Salleko ikastetxeetan, Zarautzen eta Donostian, eta aldi berean, Donstiako Sakura Klub desagertuan prestatzen zen, Ángel Monreal Cordobés maisu entrenatzaile nazionalak ikuskatuta.
1979an, lan pedagogikoarekin segitzen du, eta "Anaka Judo Kluba” sortu zuen Anakako auzoan.
Judoko entrenatzaile eta arbitro nazionala da; lan hori Bartzelonako olinpiadetan egin zuen.
2008ko abenduan, eta Espainiako Judoaren Gala Nazionalean, Madrileko Espainiako Batzorde Olinpikoaren auditorioan, Judoko Gerriko Gorri eta Zuriaren 7. Danaren Goi-maila egiaztatzen duen diploma eta karneta eman zioten, bere kirol ibilbidean lortutako merituak aitortzeko.
